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アイテム
Broadened substrate specificity of bacterial dipeptidyl-peptidase 7 enables release of half of all dipeptide combinations from peptide N-termini
http://hdl.handle.net/10069/0002002440
http://hdl.handle.net/10069/00020024407297fb69-f633-4028-86d5-0cf63cfa1f43
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
ISYK1688_Shirakura.pdf (1.4 MB)
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| アイテムタイプ | 学位論文 / Thesis or Dissertation(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2025-06-13 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | Broadened substrate specificity of bacterial dipeptidyl-peptidase 7 enables release of half of all dipeptide combinations from peptide N-termini | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | eng | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | DPP5 | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | DPP7 | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | incretin | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | periodontal disease | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | Porphyromonas gingivalis | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | substrate specificity | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_db06 | |||||||
| 資源タイプ | doctoral thesis | |||||||
| アクセス権 | ||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||
| 著者 |
白倉, 佳奈
× 白倉, 佳奈
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| 著者別名 | ||||||||
| 姓名 | Shirakura, Kana | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||
| 内容記述 | Dipeptide production mediated by dipeptidyl-peptidase (DPP)4, DPP5, DPP7, and DPP11 plays a crucial role in growth of Porphyromonas gingivalis, a periodontopathic asaccharolytic bacterium. Given the particular P1-position specificity of DPPs, it has been speculated that DPP5 or DPP7 might be responsible for degrading refractory P1 amino acids, i.e., neutral (Thr, His, Gly, Ser, Gln) and hydrophilic (Asn) residues. The present results identified DPP7 as an entity that processes these residues, thus ensuring complete production of nutritional dipeptides in the bacterium. Activity enhancement by the P1′ residue was observed in DPP7, as well as DPP4 and DPP5. Toward the refractory P1 residues, DPP7 uniquely hydrolyzed HX|LD-MCA (X = His, Gln, or Asn) and their hydrolysis was most significantly suppressed in dpp7 gene-disrupted cells. Additionally, hydrophobic P2 residue significantly enhanced DPP7 activity toward these substrates. The findings propose a comprehensive 20 P1 × 20 P2 amino acid matrix showing the coordination of four DPPs to achieve complete dipeptide production along with subsidiary peptidases. The present finding of a broad substrate specificity that DPP7 accounts for releasing 48 % (192/400) of N-terminal dipeptides could implicate its potential role in linking periodontopathic disease to related systemic disorders. | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 内容記述 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | 長崎大学学位論文 学位記番号:博(医歯薬)甲第1688号 学位授与年月日:令和7年3月19日 | |||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 内容記述 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | Author: Kana Shirakura, Takayuki K. Nemoto, Yuko Ohara Nemoto, Haruka Nishimata, Momo Sawase, Yu Shimoyama, Manami Nakasato-Suzuki, Kiyoshi Ito and Naomi Tanoue | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 内容記述 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | Citation: Biological Chemistry, 406(1-2), pp.51-64; 2025 | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 書誌情報 |
en : Biological Chemistry 巻 406, 号 1-2, p. 51-64, 発行日 2025-03-19 |
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| ISSN | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||
| 収録物識別子 | 1431-6730 | |||||||
| DOI | ||||||||
| 関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||
| 関連識別子 | 10.1515/hsz-2024-0156 | |||||||
| 権利 | ||||||||
| 権利情報 | © 2025 the author(s), published by De Gruyter. This work is licensed under the Creative Commons Attribution 4.0 International License. | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 著者版フラグ | ||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||
| その他のタイトル | ||||||||
| その他のタイトル | 細菌のDPP7の広範囲な基質特異性により全ジペプチドの組み合わせのうちの半分をペプチドのN末端から切り離すことができる | |||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | ||||||||
| 出版者 | De Gruyter | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 関係URI | ||||||||
| 識別子タイプ | HDL | |||||||
| 関連識別子 | http://hdl.handle.net/10069/0002002324 | |||||||
| 学位名 | ||||||||
| 学位名 | 博士(歯学) | |||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 学位授与機関 | ||||||||
| 学位授与機関識別子Scheme | kakenhi | |||||||
| 学位授与機関識別子 | 17301 | |||||||
| 学位授与機関名 | Nagasaki University (長崎大学) | |||||||
| 学位授与年月日 | ||||||||
| 学位授与年月日 | 2025-03-19 | |||||||
| 学位授与番号 | ||||||||
| 学位授与番号 | 甲医歯薬第1688号 | |||||||
| 学位の種類 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 値 | 課程博士 | |||||||
| 引用 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | Nagasaki University (長崎大学), 博士(歯学) (2025-03-19) | |||||||
